摘要：
菌目」（Actinomycetes）。但因爲放线菌没有核膜，且细胞壁由肽聚糖组成，和其它细菌一样。目前透过分子生物学方法，放线菌被確定爲细菌的一个大分支。放线菌用革兰氏染色可染成紫色（阳性），和另一类革兰氏阳性菌——厚壁菌门相比，放线菌的GC含量较高。但2012年的研究显示，一些淡水的放线菌。...
菌目」（Actinomycetes）。但因爲放线菌没有核膜，且细胞壁由肽聚糖组成，和其它细菌一样。目前透过分子生物学方法，放线菌被確定爲细菌的一个大分支。放线菌用革兰氏染色可染成紫色（阳性），和另一类革兰氏阳性菌——厚壁菌门相比，放线菌的GC含量较高。但2012年的研究显示，一些淡水的放线菌。
隱孔菌，又称松橄欖、树疙瘩、荷色菌、木鱼菌、香木兰等名，属多孔菌科一种，是木棲腐生的中小型菇类，该菇类生长於如台湾之中低海拔林区。该菇类最大特色是，加工后可作为抗过敏药物。 周文能、张东柱，《野菇图鑑》，2005年，台北，台湾馆出版社。
隱 kong jun ， you cheng song gan 欖 、 shu ge da 、 he se jun 、 mu yu jun 、 xiang mu lan deng ming ， shu duo kong jun ke yi zhong ， shi mu 棲 fu sheng de zhong xiao xing gu lei ， gai gu lei sheng chang yu ru tai wan zhi zhong di hai ba lin qu 。 gai gu lei zui da te se shi ， jia gong hou ke zuo wei kang guo min yao wu 。 zhou wen neng 、 zhang dong zhu ， 《 ye gu tu 鑑 》 ， 2 0 0 5 nian ， tai bei ， tai wan guan chu ban she 。
γ‐变形菌纲（学名：Gammaproteobacteria）属于细菌界变形菌门，是目前所知的细菌中种类最多的一纲，包括一些医学上和科学研究中很重要的类群，如肠桿菌科（Enterobacteraceae）、弧菌科（Vibrionaceae）和假单胞菌科（Pseudomonadaceae）。很多重要的病。
伪诺卡氏菌属（学名：Pseudonocardia）也称假诺卡氏菌属、类诺卡氏菌属，是伪诺卡氏菌科下的一个属。 本属包括以下物种： Pseudonocardia acaciae Duangmal et al. 2009 Pseudonocardia acidicola Klaysubun et al。
参见古细菌。 初古菌属(Korarchaeum)* 纳古菌属(Nanoarchaeum)* 餐古菌目(Cenarchaeales) 餐古菌科(Cenarchaeaceae)* 餐古菌属(Cenarchaeum)* 亚硝化暖菌目(Nitrosocaldales)* 亚硝化暖菌科(Nitrosocaldaceae)*。
黏菌分布於世界各地，具有许多不同的分类群，是生态系统中的重要分解者之一。其中较为著名两大类是原生质体黏菌与细胞性黏菌。其中原生质体黏菌在分类上称为黏菌亚纲（Myxogastria），也称为「真黏菌」或「非细胞黏菌」。而细胞性黏菌则属於网柱黏菌。
念珠菌症（英语：candidiasis）是假丝酵母属（一类酵母菌）所造成的真菌病，在感染口腔时，就会引发鹅口疮（thrush）。症状和病征包括在舌头、口腔以及咽喉的部位出现小白点，也可能产生例如酸痛或吞嚥困难等的其他征候。当它感染阴道，就会引起一般称作酵母菌感染（yeast。
菌盖（pileus）又称蕈盖、菌伞、菌帽，是真菌子实体上部的伞状部分。它是伞菌（英语：Agaric）、牛肝菌以及部分多孔菌、齿菌（英语：tooth fungi）和子囊果所独有的特征。其他孢子果类型的菌盖与子实体的其余部分难以区分。带有菌盖的孢子果通常有着某类子实层体，譬如生长在菌盖下侧的菌褶、菌管或菌齿。有些真菌蕈伞上方覆有菌盖皮。。
隐团菌纲（学名：Cryptomycocolacomycetes）是担子菌门柄锈菌亚门下的一个纲。该纲仅含一个目与一个科，即隐团菌目（学名：Cryptomycocolacales）与隐团菌科（学名：Cryptomycocolacaceae）。其下又包含2个单型属。 隐团菌纲（Cryptomycocolacomycetes）。
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黑粉菌目（学名：Ustilaginales）是担子菌门黑粉菌纲下的一目。该目真菌是重要的植物病原菌，可引起多种植物的黑粉病。另有少数黑粉菌的菌瘿可食用，如原产自墨西哥的玉米蘑菇（玉米黑粉菌）、原产自中国的茭白（菰黑粉菌）等。 该目共包含8科、49属、851种。 本科包括以下属： 炭黑粉菌科 Anthracoideaceae。
菌和黑粉菌外担子果多大而显著。 由67位真菌学家一个联合所采用的最新的分类认可三种亚门（柄锈菌亚门，黑粉菌亚门，伞菌亚门）和两个其他纲级别的类群（节担菌纲，根肿黑粉菌纲），除了担子菌门之外。截至目前分类的亚门合并，和削减了在以前常用来描述担子菌。
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疣微菌门（Verrucomicrobia）是一门被划出不久的细菌，包括少数几个被识別的种类，主要被发现於水生和土壤环境，或者人类粪便中。还有很多未被成功培养的种类是和真核宿主共生的，包括一些原生生物的外共生菌和线虫动物配子中的内共生菌。 疣微菌门生物中的疣微菌。
菌的菌群生长速度加快，影响肠道中其他细菌，引发炎症。 艰难拟梭菌是梭菌属的一个成员，对氧十分敏感，很难分离培养，故得名。梭菌属成员很多，可分为几个群，其中有几个成员对人是致病性的。最著名的有产气荚膜梭菌、破伤风梭菌和肉毒梭菌。产气荚膜梭菌可引起伤口气性坏疽、食物中毒、肌肉坏死、梭菌。
菌。形成菌异营的菌根属於外菌根（英语：Ectomycorrhiza）、丛枝菌根（英语：Arbuscular mycorrhiza）与兰菌根者皆有，行菌异营的植物与真菌相当多样，且在分类上分属不同类群，表示菌异营是从菌根多次平行演化而出现的交互作用。 菌异营可能是由互利共生的菌。
变形菌门（学名：Pseudomonadota，旧名 Proteobacteria）是细菌中主要的一门，包括很多病原菌，如大肠杆菌、克雷伯氏菌、沙门氏菌、志贺氏菌、绿脓杆菌、霍乱弧菌、鼠疫杆菌、脑膜炎双球菌、淋球菌、空肠弯曲菌、幽门螺杆菌等著名的属。也有自由生活（非寄生）的种类，包括很多可以进行固氮的细菌。。
菌根（英语：mycorrhiza）是维管束植物的根与真菌组成的共生关系体，可协助植物吸收水分与养分；该关系一般是互利共生的，但偶尔是弱致病性的。菌根在土壤生物学和土壤化学中具有重要作用。 在菌根关系体中，真菌定殖于宿主植物根的方式，有的是内生菌根，如丛枝菌根真菌（AMF 或 AM），其菌。
梭菌属（学名：Clostridium），菌体呈梭状，又称梭状芽孢桿菌属或厌氧芽孢桿菌属，芽孢常比菌体大，是一类能产生内生孢子的厌氧性革兰氏阳性菌。 梭菌属广泛分布於自然界，以土壤中最多，芽孢圆形或椭圆形。除了产气荚膜梭菌无鞭毛外，大多有鞭毛。大部份的梭菌属可以水解糖、蛋白质，又可产生外毒素，成为一些疾病的原因。。
革兰氏阴性菌（英语：Gram-negative bacteria）泛指革兰氏染色反应呈红色的细菌。在革兰氏染色实验中，首先添加了结晶紫，再添入另一种复染染料（通常使用番红），从而将所有的革兰氏阴性菌染成红色或粉色。通过这种测试我们可以区分两种细胞壁结构不同的细菌。革兰氏阳性菌。
而得名，但近年来发现並非所有的丛枝菌根菌皆可於根內形成上述两种构造， 因此已改称为丛枝菌 (arbuscular mycorrhiza, AM) 。 Gigaspora 和Scutellospora 两属的丛枝菌根菌皆是將囊泡 (vesicle) 产生於根外土壤中。 菌丝膨大而形成，储存能量(lipid)，不是每种內生菌根菌都有，形成於细胞內或细胞间。。
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立更多的门类。在这些类群中，研究最深入的是泉古菌门与广古菌门。但对古菌进行分类仍然是困难的，因为绝大多数的古菌都无法在实验室中纯化培养，只能通过环境宏基因组检测来分析。 古菌和细菌的大小和形状非常相似，但少数古菌有不寻常的形状，如嗜盐古菌窝氏盐方扁平古菌（英语：Haloquadratum。
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